В упомянутом письме говорится, что нельзя принимать расходы, понесенные во время
применения ПСН. Ваш ИП в последний раз применял ПСН на законных основаниях только в 1 квартале 2018 года. С 1 апреля 2018 года он утратил право применения патента и с этой же даты считается перешедшим на УСН.
Лично я не вижу препятствий для полноценного перерасчета (с учетом доходов и расходов) налоговой базы по УСН, начиная с 1 апреля.
Цитата: 7.Суммы налогов, подлежащие уплате в соответствии собщим режимом налогообложения (упрощенной системой налогообложения, системой налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей), а также суммы торгового сбораза период, в котором индивидуальный предприниматель утратил право на применение патентной системы налогообложенияпо основаниям, указанным в пункте 6 настоящей статьи,исчисляются и уплачиваются индивидуальным предпринимателем в порядке, предусмотренном законодательством Российской Федерации о налогах и сборах для вновь зарегистрированных индивидуальных предпринимателей.При этом указанные индивидуальные предпринимателине уплачивают пени в случае несвоевременной уплаты налогов (авансовых платежей по налогам), подлежащих уплате в соответствии с общим режимом налогообложения (упрощенной системой налогообложения, системой налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей), и сумм торгового сбора в течение того периода, в котором применялась патентная система налогообложения.Сумма налога на доходы физических лиц,сумма налога, уплачиваемого при применении упрощенной системы налогообложения, сумма налога, уплачиваемого при применении системы налогообложения для сельскохозяйственных товаропроизводителей, подлежащие уплате за налоговый период, в котором индивидуальный предприниматель утратил право на применение патентной системы налогообложения в соответствии с пунктом 6 настоящей статьи,уменьшаются на сумму налога, уплаченного в связи с применением патентной системы налогообложения.
Но Вы можете конечно задать этот вопрос и в ИФНС, попросив дать официальный ответ.